精子畸形率高应引起重视，通常应正确对待，以增加生育健康宝宝的机会。中医认为，肾虚、湿热下注或伴有气滞是畸形精子过多的病理基础，可以用中药或中成药辨证治疗。西医认为，精子畸形率过高的原因包括：感染、高温、辐射、某些药物的作用、精索静脉曲张、遗传等。西医常用抗感染药物、抗氧化药物和微量元素来治疗精子畸形。
虽然畸形精子症主要与母体环境、药物、遗传、外界不良环境等因素有关，但并不代表畸形精子症没有危害，至少会使男性生育能力下降，所以还是需要引起重视。那么，畸形精子症该如何治疗呢。根据最新的《中国畸形精子症诊治专家共识》，治疗要点如下：
1. 一般治疗
包括戒烟限酒、控制体重、适量运动（注意高强度运动反而会降低精子质量）、避免高温作业、减少雌激素类物质的摄入等。
2. 药物治疗
(1）无论精子畸形症的病因如何，抗氧化治疗（辅酶Q0、左旋肉碱、叶酸等）可能对改善精子畸形率有益，但能否提高临床妊娠率仍缺乏足够的证据；
(2）抗感染治疗，对于男性生殖道感染，合理使用抗生素有可能改善精子畸形率，但对于非男性生殖道感染，抗生素治疗并不能有效改善精子畸形症，不建议盲目使用。
(3）中医治疗，临床辨证一防虚实，二防阴阳，根据诊断对症下药。
3.手术治疗
如精索静脉结扎术。
4. 辅助生殖
在辅助生殖过程中，应结合患者正常形态精子百分比、精子浓度及活力来选择辅助生殖的方法。
精子畸形率高如何选择辅助受孕方法 精子畸形率高如何选择辅助受孕方法 畸形精子症患者精子浓度≥5×10^6ml，可行常规试管婴儿（试管婴儿）； 在剔除女方年龄因素和平均活动精子总数10×10^6的前提下，正常形态精子比例≥1%或1%与宫腔内人工授精（IUI）的临床妊娠相比无明显差异，宫腔内人工授精（IUI）的临床妊娠。考虑到时间和经济成本，目前可以尝试 IUI 助孕。
对于遗传率高、药物或手术治疗无效的特殊类型畸形精子，如圆头精子症、无精子症、巨畸症等，根据精子缺陷类型及其对受精和胚胎发育的影响，选择个体化辅助生殖技术进行辅助受精，如 如Ⅱ型圆头精子症可选择含有顶体的精子进行ICSI治疗，而Ⅰ型圆头精子症往往需要联合AOA治疗，为避免遗传风险和反复ICSI失败，圆头精子症也可采用直接捐精治疗。